微生物實驗室是進行微生物研究的場所，對環境要求很高，必須保證實驗室內的環境潔凈安全，嚴格的消毒滅菌工作非常重要，影響著實驗室順利研究實驗的順利進行，同時嚴格的消毒滅菌也為實驗室工作人員提供一個清潔而良好的工作環境。
目前，常用的消毒滅菌方法多采用物理方法(如，干熱滅菌法、濕熱滅菌法、過濾除菌法、射線殺菌法等)和化學方法兩大類。
1.干熱滅菌法
是利用恒溫干燥箱內120℃-150℃的高熱，并保持90-120分鐘，殺死細菌和芽孢，達到滅菌目的的一種方法。
主要適用于不易被高溫損壞的玻璃器皿、金屬器械以及不能和蒸汽接觸的物品的滅菌。用此方法滅菌的物品干燥，易于貯存。酒精燈火焰燒灼滅菌法也是屬于干熱滅菌的方法之一，在進行動物細胞體外培養工作時，常須利用工作臺面上的酒精燈火焰對金屬器具及玻璃器皿口緣進行補充滅菌。
2.濕熱滅菌法
壓力蒸汽濕熱滅菌法是目前蕞常見的一種滅菌方法。它利用高壓蒸汽以及在蒸汽環境中存在的潛熱作用和良好的穿透力，使菌體蛋白質凝固變性而使微生物死亡。
適合于布類工作衣、各種器皿、金屬器械、膠塞、蒸餾水、棉塞、紙和某些培養液的滅菌。高壓蒸汽滅菌器的蒸汽壓力一般調整為1.0-1.1 kg/cm2，維持20-30min即可達到滅菌效果。
3.過濾除菌法
是將液體或氣體通過有微孔的濾膜過濾，使大于濾膜孔徑的細菌等微生物顆粒阻留，從而達到除菌的方法。過濾除菌法大多用于遇熱易發生分解、變性而失效的試劑、酶液、血清、培養液等。
目前，常用微孔濾膜金屬濾器或塑料濾器正壓過濾除菌，或用玻璃細菌濾器、濾球負壓過濾除菌。濾膜孔徑應在0.22-0.45μm范圍內或用更小的細菌濾膜，溶液通過濾膜后，細菌和孢子等因大于濾膜孔徑而被阻，并利用濾膜的吸附作用，阻制小于濾膜孔徑的細菌透過。
4.射線滅菌法
利用紫外線燈進行照射滅菌的方法。紫外線是一種低能量的電磁輻射，可以殺滅多種微生物。紫外線的作用機制是通過對微生物的核酸及蛋白質等的破壞作用而使其滅活。
適合于實驗室空氣、地面、操作臺面滅菌。滅菌時間為30min。用紫外線殺菌時應注意，不能邊照射邊進行實驗操作，因為紫外線不僅對人體皮膚有傷害，而且對培養物及一些試劑等也會產生不良影響。
5.化學消毒劑消毒法
化學消毒劑使用范圍比較廣泛，可用于那些不能利用物理方法進行滅菌的物品、空氣、工作面、操作者皮膚、某些實驗器皿等。常用的化學消毒劑包括甲醛、高錳酸鉀、70%-75%乙醇、過氧乙酸、新潔爾滅、環氧乙烷、以及過氧化氫等。但是普通的化學消毒劑有殘留和腐蝕性，在使用時應注意安全，特別是用在皮膚或實驗材料上的消毒劑，須選用合適的藥劑種類、濃度和處理時間，才能達到安全和滅菌的目的。而目前*食品級過氧化氫消毒劑具有安全綠色無殘留的特點，可以進行實驗材料的滅菌，同時搭配過氧化氫干霧滅菌器可以對無菌室和培養室的空氣消毒。
微生物實驗室是一個潔凈度要求很高的環境，對于微生物檢測用的玻璃器皿、金屬用具及培養基、被污染和接種的培養物等，必須經滅菌后方能使用。
