耐熱DNA聚合酶多應用在PCR技術中。各種耐熱DNA聚合酶均具有5'-3'聚合酶活性，但不一定具有3'-5'和5'-3'的外切酶活性。3'-5'外切酶活性可以消除 錯配，切 平末端；5'-3'外切酶活性可以消除合成障礙。由于上述這些不同，可以將耐熱DNA聚合酶分為三類，下面遠慕生物簡單介紹一下。
一、普通耐熱DNA聚合酶
Taq DNA 聚合酶
由一種水生棲熱菌yT1株分離提取出，是發現的耐熱DNA聚合酶中活性最高的一種，達200,000單位/mg。具有5'-3'外切酶活性，但不具有3'-5'外切酶活性，因而在合成中對某些單核苷酸錯配沒有校正功能。
TaqDNA聚合酶還要具有非模板依賴性活性，可將PCR雙鏈產物的每一條鏈3'加入單 核苷酸尾，故可使PCR產物具有3'突出的單A核苷酸尾；另一方面，在僅有dTTP存在時，它可將 平端的 質粒的3'端加入單T核苷酸尾，產生3'端突出的單T核苷酸尾。應用這一特性，可實現PCR產物的 T-A克隆法。
Tth DNA 聚合酶
從Thermus thermophilus HB8中提取而得，該酶在高溫和MnCl2條件下，能有效地 逆轉錄RNA；當加入Mg2+后，該酶的聚合活性大大增加，從而使cDNA合成與擴增可用一種酶催化。
二、高保真DNA聚合酶
pfu DNA 聚合酶
是從Pyrococcus furiosis中精制而成的高保真耐高溫DNA聚合酶，它不具有5'-3'外切酶活性，但具有3'-5'外切酶活性，可校正 PCR擴增過程中產生的錯誤，使產物的 堿基 錯配率極低。PCR產物為 平端，無3'端突出的單A核苷酸。
Vent DNA 聚合酶
該酶是從Litoralis棲熱球菌中分離出的，不具有5'-3'外切酶活性，但具有3'-5'外切酶活性，可以去除錯配的堿基，具有校對功能。
三、DNA序列測定中應用的耐熱DNA聚合酶
測序級TaqDNA聚合酶
是在TaqDNA聚合酶的基礎上對它進行修飾，去除5'-3'外切酶活性，保證測序記過的高度準確性，可產生強度均一的測序條帶，背景清晰。
Bca Best DNA 聚合酶
從Bacillus Caldotenax YT-G菌株中提純，并使其5'-3'外切酶活性缺失的DNA聚合酶。它的伸長性能*；可抑制 DNA二級結構形成，可以得到均一的DNA測序帶。
Sac DNA 聚合酶
從酸熱浴流化裂片菌中分離，無3'-5'外切酶活性，可用于DNA 測序，但測序反應中ddNTP/dNTP的比率要高。
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